以前はゴンズイとされていましたが2008年にミナミゴンズイとして別種になっています。 ただ、学名は以前のゴンズイを引き継いでいます。本家のゴンズイにはPlotosus japonicusという 新しい学名が付けられました。 ゴンズイとミナミゴンズイは外見では区別がつきづらく、背鰭と胸鰭 に毒のある棘があるのも一緒です。